De amerikanska medierna Axios och The New York Times skriver att en av dem var den som antas efterträda den dödade tidigare ledaren Hassan Nasrallah, nämligen Hashem Safieddine.
De stödjer sig på uppgifter från flera källor.
Massiva explosioner hördes i samband med de israeliska flygräderna med bomber mot det som uppges vara bunkern i södra Beirut. Tryckvågorna kändes vida i staden.
Det finns ingen bekräftelse om den tänkte efterträdaren Safieddine (ibland stavat Safi al-Din) fanns där eller om han i så fall dödades. Nasrallah, som lett den extremislamistiska rörelsen, dödades i en liknande räd mot en bunker under ett bostadsområde i Beirut förra veckan..